در سامانه مودیان مالیاتی، که بر اساس قانون پایانه‌های فروشگاهی و سامانه مودیان طراحی شده، صدور فاکتورهای الکترونیکی بدون استفاده از امضای دیجیتال امکان‌پذیر نیست. این امضا با بهره‌گیری از کلیدهای عمومی و خصوصی (جفت کلیدهای رمزنگاری نامتقارن) انجام می‌شود و نقش حیاتی در تضمین امنیت، اصالت و عدم تغییرپذیری اطلاعات فاکتورها ایفا می‌کند.

کلید خصوصی یک کلید کاملاً محرمانه است که فقط در اختیار مالک (مودی مالیاتی) قرار دارد. این کلید برای امضای دیجیتال فاکتورها استفاده می‌شود؛ یعنی فرستنده (مثلاً فروشنده) با آن، داده‌های فاکتور را امضا می‌کند تا اثبات کند که اطلاعات از سوی او ارسال شده و دستکاری نشده است. در مقابل، کلید عمومی برای تأیید امضا و رمزگشایی اطلاعات به کار می‌رود. این کلید می‌تواند به صورت عمومی (مثلاً با سامانه مودیان یا گیرنده فاکتور) به اشتراک گذاشته شود و مانند یک “قفل عمومی” عمل می‌کند که فقط با کلید خصوصی مربوطه باز می‌شود.

این جفت کلیدها بر پایه الگوریتم‌های رمزنگاری مانند RSA کار می‌کنند و بدون آن‌ها، فاکتورهای الکترونیکی در کارپوشه سامانه مودیان ثبت یا ارسال نمی‌شوند. علاوه بر این، برای تکمیل فرآیند، نیاز به فایل CSR (Certificate Signing Request) دارید که حاوی   اطلاعات هویتی شماست و برای دریافت گواهی امضای دیجیتال از مراکز معتبر (مانند مراکز صدور گواهی الکترونیکی) استفاده می‌شود. عدم استفاده از این کلیدها نه تنها فرآیند صدور فاکتور را مختل می‌کند، بلکه می‌تواند منجر به جریمه‌های سنگین مالیاتی و مشکلات حقوقی شود، زیرا امنیت مکاتبات مالیاتی را به خطر می‌اندازد.